インフォアイのILSをご利用いただければ改善可能です。
店舗から自店舗の在庫、各店舗の在庫、倉庫のフリー在庫を参照できますので　各店同士にて確認しての在庫移動が可能です。

しかし　本部のみで在庫関連は取り扱いたい　場合は　店舗での在庫表示をなくす事も可能です。